Démarche d'observation naturaliste

Observations publiées sur iNaturalist · frederic_pallu

🔭 naturaliste

Observations, visualisations et premières analyses produites à partir de mes données naturalistes publiées sur iNaturalist. Au-delà de l'aide à l'identification, j'utilise la plateforme selon trois objectifs distincts : la billebaude, les observations protocolées, et la structuration par projets collaboratifs.

  1. Objectif 1
    La billebaude

    Observations spontanées de terrain, au fil des sorties naturalistes, ou au hasard du quotidien, sans protocole ni secteur défini à l'avance.

  2. Objectif 2
    Les observations protocolées

    Les observations issues de ces protocoles sont également saisies dans iNaturalist, en complément des bases de données officielles. L'objectif est double : consolider un corpus personnel géolocalisé, et encourager tous les participants à saisir leurs données via une interface simple et accessible.

    • PROPage — suivi des papillons de jour par transects, sur une liste de 38 espèces indicatrices, à destination des gestionnaires d'espaces verts et naturels
    • STERF — suivi temporel exhaustif des papillons de jour par transects, ouvert à tous les naturalistes
    • POPreptiles — suivi des populations de reptiles par plaques-abri standardisées
    • Comptage des oiseaux des jardins — dénombrement ponctuel des oiseaux observés depuis chez soi, coordonné nationalement par la LPO
  3. Objectif 3
    La structuration des observations par projets collaboratifs
Outils et méthodes

Les données collectées — individuellement ou via les projets collaboratifs — alimentent des analyses et des représentations cartographiques statiques ou interactives. Pour les saisies complexes de terrain, QField complète iNaturalist : les deux systèmes sont ensuite fusionnés dans QGIS ou Excel.

L'alimentation du GBIF (Global Biodiversity Information Facility) depuis les observations iNaturalist a été vérifiée. Le SINP (Système d'information de l'inventaire du patrimoine naturel) collecte les données concernant le territoire français depuis les bases GBIF.

Flux de données : de la saisie au SINP
Naturaliste (saisie sur iNaturalist) Communauté (validation collaborative) iNaturalist (Research Grade · licence CC) Observations RG GBIF (export hebdomadaire) Données françaises SINP (inventaire national) Conditions requises ① Licence CC BY ou CC BY-NC ② Statut Research Grade ③ Géolocalisation non masquée ④ Export automatique chaque semaine ⑤ Territoire français → collecte SINP

Cliquez sur chaque bloc pour en savoir plus.

Bien régler ses licences Creative Commons pour la science et le GBIF

Sur iNaturalist, trois licences se règlent séparément : celle de l'observation (la donnée — espèce, date, lieu), celle des images et celle des sons qui l'accompagnent. Pour qu'une contribution serve pleinement le travail scientifique, ces trois licences doivent être ouvertes : c'est la condition pour que la donnée et ses médias (photos comme enregistrements sonores) soient exportés vers le GBIF, puis collectés par le SINP.

Le GBIF n'ingère que les contenus publiés en CC0, CC BY ou CC BY-NC. Toute licence plus restrictive — les variantes -ND (pas de modification), -SA (partage à l'identique) ou le statut « Tous droits réservés » — bloque l'export, aussi bien pour l'observation que pour ses images et ses sons. Une observation bien licenciée dont les médias restent « Tous droits réservés » prive la communauté de l'illustration (ou de l'enregistrement), pourtant essentielle à la revérification des déterminations.

Recommandation — appliquer la même licence aux trois réglages — observation, image et son — par cohérence, et choisir CC BY (Creative Commons Attribution) : c'est le meilleur compromis, votre nom reste cité à chaque réutilisation et la donnée comme les médias deviennent pleinement réutilisables et exportés. CC0 (domaine public) convient pour un partage sans aucune condition. CC BY-NC reste exporté vers le GBIF mais réserve l'usage au non-commercial et limite les réutilisations institutionnelles : à choisir seulement si la clause non commerciale vous importe.

Mode d'emploi — environ deux minutes
  1. Sur un ordinateur, ouvrez les paramètres du compte, puis, dans le menu de gauche, choisissez Contenu et affichage.
  2. Dans le paragraphe Mise sous licence, choisissez la même licence (CC BY conseillée) pour les trois menus : observations, photos et sons.
  3. Cochez les cases « mettre à jour les observations / photos / sons existants » pour appliquer le choix à toutes vos données déjà publiées, et pas seulement aux futures.
  4. Enregistrez les paramètres.

Le SINP (Système d'information de l'inventaire du patrimoine naturel) collecte les occurrences françaises directement depuis le GBIF : de bonnes clauses CC ne nourrissent donc pas seulement le GBIF, elles alimentent aussi, en cascade, le SINP et les outils publics de connaissance et de protection de la biodiversité. À l'inverse, une licence trop restrictive arrête la donnée dès iNaturalist.

Les licences peuvent être modifiées à tout moment dans iNaturalist ; ce réglage vaut pour les réutilisations futures.

Le flux iNaturalist → QGIS → GBIF est piloté en langage naturel via Claude et MCP — → voir la démonstration de l'architecture technique

Naturaliste

Chaque observation saisie sur iNaturalist comprend une photo, une géolocalisation précise, une date et une identification. L'identification peut être soumise par l'observateur ou suggérée par la reconnaissance automatique d'image intégrée à la plateforme.

Les observations publiées sous licence Creative Commons sont éligibles à l'export vers le GBIF, à condition d'atteindre le statut Research Grade.

Communauté (validation collaborative)

La validation repose sur le consensus communautaire : d'autres membres confirment ou corrigent l'identification proposée. Lorsque deux tiers des avis concordent avec au moins deux identifiants distincts, l'observation atteint le statut Research Grade.

Ce mécanisme assure un niveau de fiabilité suffisant pour l'intégration dans les bases scientifiques.

iNaturalist

iNaturalist est une plateforme mondiale de sciences participatives permettant de documenter la biodiversité. Les observations Research Grade, publiées sous licence CC BY ou CC BY-NC, sont exportées automatiquement chaque semaine vers le GBIF.

Co-gérée par le California Academy of Sciences et la National Geographic Society, la plateforme héberge plus d'un milliard d'observations à l'échelle mondiale.

GBIF — Global Biodiversity Information Facility

Le GBIF est une infrastructure internationale d'accès libre aux données sur la biodiversité, centralisant des milliards d'occurrences provenant de milliers de sources, dont iNaturalist. Il standardise et redistribue ces données pour la recherche et les politiques publiques.

Les occurrences relatives au territoire français transitant par le GBIF sont ensuite collectées par le SINP.

SINP — Système d'Information de l'Inventaire du Patrimoine Naturel

Le SINP est le dispositif français de référence pour la centralisation des données sur la biodiversité du territoire national. Il collecte les occurrences françaises depuis les bases GBIF ainsi que d'autres sources institutionnelles.

Ces données alimentent les outils de connaissance de la biodiversité, les documents d'urbanisme et les politiques de conservation.